Data Entry: Please note that the research database will be replaced by UNIverse by the end of October 2023. Please enter your data into the system https://universe-intern.unibas.ch. Thanks

Login for users with Unibas email account...

Login for registered users without Unibas email account...

 
Advanced Imaging System for Biomolecular Crystallization Screening
Third-party funded project
Project title Advanced Imaging System for Biomolecular Crystallization Screening
Principal Investigator(s) Maier, Timm
Co-Investigator(s) Hiller, Sebastian
Schirmer, Tilman
Stahlberg, Henning
Organisation / Research unit Departement Biozentrum / Structural Biology (Maier)
Project start 01.12.2012
Probable end 30.11.2013
Status Completed
Abstract

Proteine üben eine Vielzahl biologischer Funktionen aus und besitzen eine an ihre spezifische Aufgabe angepasste Struktur. Die Aufklärung dieser Raumstruktur ermöglicht Einsichten in biologische Mechanismen. Die erfolgreichste Technik hierzu ist die Röntgenkristallographie, die im wesentlichen nur durch die Suche nach Kristallisationsbedingungen eingeschränkt ist. Das beantragte Bildgebungssystem verwendet neue optische Methoden um diesen Engpass für die Proteinstrukturbestimmung zu beseitigen.

Die Aufklärung von Proteinstrukturen erlaubt Einsichten in biologische Mechanismen mit atomarer Auflösung und leistet einen Beitrag zur Entwicklung neuer Medikamente. Die wichtigste Technik zur Strukturaufklärung ist die Kristallographie. Sie ermöglicht es, die Strukturen von Proteinen aller Arten und Grössen bis hin zu riesigen molekularen Maschinen bei hoher Auflösung zu untersuchen. Eine wesentliche Vorbedingung für die kristallographische Untersuchung ist allerdings das Züchten von Kristallen des jeweiligen Proteins. Die Kristallisation selber und optimale Kristallisationsbedingungen sind nicht vorhersagbar, sondern werden in empirischen Reihentests bestimmt. Trotz moderner Robotik ist das Züchten grosser Kristalle immer noch der wesentliche Engpass der Proteinkristallographie. Neuartige Röntgenquellen, die sogenannten Freien Röntgenlaser ermöglichen seit kurzem das Arbeiten mit immer kleineren Kristallen bis in den Submikrometerbereich. Generell ist das Auffinden von Kristallen in Kristallisationstropfen ein schwieriger Vorgang, der bisher zumeist mit Hilfe von Hellfeldmikroskopie durchgeführt wurde. Das beantragte Gerät ist ein Hochdurchsatz-System zur Aufbewahrung und mikroskopischen Analyse von Proteinkristallisationsansätzen, das neben der Hellfeldmikroskopie eine zusätzliche Laser-basierte Bildgebungstechnik nutzt. Diese sog. SHG-Methode erlaubt die spezifische Detektion von hochperiodischen Materialien, wie Kristallen, selbst in optisch inhomogenen Kristallisationstropfen und ist sensitiv genug, um Submikrometer-Kristalle zu detektieren. Durch den erhöhten Durchsatz und die neuartigen Detektionsmöglichkeiten trägt dieses Bildgebungssystem wesentlich zu einer erfolgreichen Aufklärung von biologisch und pharmakologisch hochrelevanten Proteinstrukturen bei

The requested advanced imaging system for biomolecular crystallization screening combines standard visual light microscopy with the advanced SONICC imaging technology, based on second harmonic generation in chiral crystals. It provides superior selectivity for crystalline material even in turbid or inhomogeneous media typically observed in biological crystallization screening. It's high sensitivity permits detection even of submicrometer-sized nanocrystals, which in combination with the recently introduced method of X-ray free electron laser based serial nanocrystallography, open a new way towards structure determination of challenging protein targets. Thus, these advanced imager helps to overcome key bottlenecks in biomolecular crystalllization screening for a number of structure determination at and beyond the Biozentrum of the University of Basel.

 

Financed by Swiss National Science Foundation (SNSF)

Published results ()

  ID Autor(en) Titel ISSN / ISBN Erschienen in Art der Publikation
2796973  Bukhari, Habib S. T.; Jakob, Roman P.; Maier, Timm  Evolutionary origins of the multienzyme architecture of giant fungal Fatty Acid synthase  0969-2126  Structure  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
2814836  Jakob, Roman P.; Koch, Johanna R.; Burmann, Björn M.; Schmidpeter, Philipp A. M.; Hunkeler, Moritz; Hiller, Sebastian; Schmid, Franz X.; Maier, Timm  Dimeric structure of the bacterial extracellular foldase PrsA  0021-9258 ; 1083-351X  Journal of Biological Chemistry  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3157890  Preston, Roland C.; Jakob, Roman P.; Binder, Florian P. C.; Sager, Christoph P.; Ernst, Beat; Maier, Timm  E-selectin ligand complexes adopt an extended high-affinity conformation  1674-2788 ; 1759-4685  Journal of Molecular Cell Biology  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3176302  Arquint, Christian; Gabryjonczyk, Anna-Maria; Imseng, Stefan; Böhm, Raphael; Sauer, Evelyn; Hiller, Sebastian; Nigg, Erich A.; Maier, Timm  STIL binding to Polo-box 3 of PLK4 regulates centriole duplication  2050-084X  eLife  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3449973  Sauer, Maximilian M; Jakob, Roman P; Eras, Jonathan; Baday, Sefer; Eriş, Deniz; Navarra, Giulio; Bernèche, Simon; Ernst, Beat; Maier, Timm; Glockshuber, Rudi  Catch-bond mechanism of the bacterial adhesin FimH  2041-1723  Nature communications  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3456240  Herbst, Dominik A.; Jakob, Roman P.; Zähringer, Franziska; Maier, Timm  Mycocerosic acid synthase exemplifies the architecture of reducing polyketide synthases  0028-0836  Nature  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3491804  Hunkeler, Moritz; Stuttfeld, Edward; Hagmann, Anna; Imseng, Stefan; Maier, Timm  The dynamic organization of fungal acetyl-CoA carboxylase  2041-1723  Nature Communications  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3564413  Hagmann, Anna; Hunkeler, Moritz; Stuttfeld, Edward; Maier, Timm  Hybrid Structure of a Dynamic Single-Chain Carboxylase from Deinococcus radiodurans  0969-2126 ; 1878-4186  Structure  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3534144  Jakob, Roman P.; Schmidpeter, Philipp A. M.; Koch, Johanna R.; Schmid, Franz X.; Maier, Timm  Structural and Functional Characterization of a Novel Family of Cyclophilins, the AquaCyps  1932-6203  PLoS ONE  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3123404  Fujieda, Nobutaka; Schaetti, Jonas; Stuttfeld, Edward; Ohkubo, Kei; Maier, Timm; Fukuzumi, Shunichi; Ward, Thomas R.  Enzyme repurposing of a hydrolase as an emergent peroxidase upon metal binding  2041-6520 ; 2041-6539  Chemical Science  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3394879  Aylett, Christopher H. S.; Sauer, Evelyn; Imseng, Stefan; Boehringer, Daniel; Hall, Michael N.; Ban, Nenad; Maier, Timm  Architecture of human mTOR complex 1  0036-8075 ; 1095-9203  Science  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
3765544  Storm, Philip A.; Herbst, Dominik A.; Maier, Timm; Townsend, Craig A.  Functional and Structural Analysis of Programmed C-Methylation in the Biosynthesis of the Fungal Polyketide Citrinin  2451-9456  Cell Chemical Biology  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
4029939  Sager, Christoph P.; Fiege, Brigitte; Zihlmann, Pascal; Vannam, Raghu; Rabbani, Said; Jakob, Roman P.; Preston, Roland C.; Zalewski, Adam; Maier, Timm; Peczuh, Mark W.; Ernst, Beat  The price of flexibility - a case study on septanoses as pyranose mimetics  2041-6520 ; 2041-6539  Chemical Science  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
4442517  Herbst, Dominik A.; Huitt-Roehl, Callie R.; Jakob, Roman P.; Kravetz, Jacob M.; Storm, Philip A.; Alley, Jamie R.; Townsend, Craig A.; Maier, Timm  The structural organization of substrate loading in iterative polyketide synthases  1552-4469  Nature Chemical Biology  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
4483794  Zihlmann, Pascal; Silbermann, Marleen; Sharpe, Timothy; Jiang, Xiaohua; Mühlethaler, Tobias; Jakob, Roman P.; Rabbani, Said; Sager, Christoph P.; Frei, Priska; Pang, Lijuan; Maier, Timm; Ernst, Beat  KinITC-One Method Supports both Thermodynamic and Kinetic SARs as Exemplified on FimH Antagonists  1521-3765  Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)  Publication: JournalArticle (Originalarbeit in einer wissenschaftlichen Zeitschrift) 
   

MCSS v5.8 PRO. 0.518 sec, queries - 0.000 sec ©Universität Basel  |  Impressum   |    
03/05/2024